In den letzten Jahren haben wir neue bildgebende Verfahren für die longitudinale Analyse von Organoiden während der Tumorentwicklung und -behandlung etabliert. In Zusammenarbeit mit dem Prevedel-Labor am EMBL wurde ein labelfreies Bildgebungssystem entwickelt, um die morphologische Charakterisierung großer Organoidpopulationen zu ermöglichen. Dazu hat das Prevedel-Labor ein OCM (optical coherence microscopy) -System entwickelt, das eine dreidimensionale Auflösung im Mikrometerbereich ermöglicht, um Zellstrukturen innerhalb intakter Organoiden sichtbar zu machen. Dies erlaubt uns, Merkmale wie Lumenbildung oder Dicke der Epithelschicht -und damit das Verhalten des TumorOrganoids- zu quantifizieren.

Gleichzeitig haben wir die funktionelle, fluoreszierende Farbstoffe zur Verwendung in der Lichtblatt-Mikroskopie (Selective Plane Illumination Microscopy / SPIM; Zusammenarbeit mit Luxendo/Bruker) optimiert, um Organoide von Patienten und Mausmodellen über bis zu vier Tage hinweg zu beobachten. Dies ermöglicht uns, die Effekte von Onkogenen oder die Behandlungen von Organoiden in Einzelzellauflösung zu überwachen.